Pierre Aronnax è un docente universitario di storia naturale a Parigi, famoso per la sua opera sulla vita sottomarina. Prende parte insieme al domestico Conseil e al fiociniere Ned Land a una spedizione per liberare definitivamente i mari da un misterioso mostro marino che affonda le navi.nI tre si imbattono nella creatura nel bel mezzo del mar del Giappone. Durante lo scontro vengono scaraventati in acqua e riescono a salvarsi rifugiandosi su quella che sembra un' isola gallegginate, ma subito scoprono di essere finiti sul famigerato mostro.nIn realtà non di mostro si tratta, ma del sottomarino corazzato Nautilus, mezzo sconosciuto in quel tempo, nel quale saranno per così dire ospiti del Capitano Nemo. Ha inizio così la loro incredibile e affascinante peregrinazione nel profondo o alla superficie degli oceani, in balia del misterioso capitano Nemo, fino al giorno in cui verrà loro rivelata la personalità di questo uomo, strano personaggio chiuso in se stesso e astioso verso il mondo terreno:  un vendicatore spietato dei torti subiti dal suo paese - l'India - per il quale l' incanto delle solitudini sottomarine è intensamente legato all' odio verso l' Inghilterra e il mondo dell' imperialismo ottocentesco. Nonostante i continui tentativi di fuga da parte di Ned Land, i personaggi visiteranno Atlantide, combatteranno contro calamari giganti e altri strani e fantastici animali marini, navigheranno sotto il canale di Suez. Solo dopo mesi, la monotonia e la cripticità di Nemo convincono Ned Land a organizzare un nuovo tentativo di fuga. In quegli istanti il Nautilus viene risucchiato dal terribile gorgo del Maelstrom e, scaraventati fuori dalla nave, i tre ospiti si risvegliano nella capanna di un pescatore in una delle isole Lofoten.