Quando Duane Barry, un ex agente del Federal Bureau of Investigations detenuto in un manicomio criminale, riesce a evadere dall'istituto in cui è rinchiuso, asserragliandosi in un'agenzia di viaggi con quattro ostaggi, le teste di cuoio dell'FBI intervengono immediatamente.
Ma che ci fa assieme a loro l'agente Fox Mulder della famigerata sezione X-Files, specializzata in casi inspiegabili e paranormali?
Il fatto è che Duane Barry non è uno psicopatico come tutti gli altri. Anche se in passato è stato ferito gravemente al cervello, una lesione che gli scatena periodiche crisi allucinatorie, Duane è in grado di documentare in maniera esauriente il rapimento da parte degli alieni di cui sostiene di essere stato vittima.
Chiunque conosca Fox Mulder può immaginare che la sua presenza sul posto equivale a gettare benzina sul fuoco.
La transitoria soluzione dell'emergenza ostaggi scatena così un dramma di portata ancora maggiore, che vedrà coinvolta anche la collega di Mulder, Dana Scully, destinata a un faccia a faccia con gli alieni che lascerà tracce indelebili nel suo corpo.