Terra 2065, distruzione e confusione sono ovunque. Le città sono deserte, la popolazione è decimata e i pochi umani rimasti lottano per sopravvivere contro un'insidiosa presenza aliena che sta consumando la stessa energia vitale di questo mondo ferito. La presenza si sta diffondendo in tutto il pianeta, infettando ogni cosa sul suo cammino, uccidendo la Terra una vita alla volta. Solo la dottoressa Aki Ross, una giovane donna brillante perseguitata da sogni di morte, può contenere la chiave per salvare il mondo. Ma il suo piano non è privo di rischi, e un generale ribelle al comando dell'esercito tecnologicamente più sofisticato della storia prenderà d'assalto il paradiso stesso per fermarla, se necessario. Ha dei piani per fermare la forza vitale aliena in un colpo decisivo, piani che trafiggeranno il cuore stesso della Natura stessa a meno che la ricerca di Aki non abbia successo.